第三眼的功能和另两只眼睛相比虽然功能迥异，但还是有点“藕断丝连”。松果腺体对太阳光有极强的敏感性，它通过神经纤维与眼睛相联系。松果腺体在太阳光十分强烈时受阳光抑制，分泌松果激素减少；反之，碰到阴雨连绵的天气，松果腺体就会分泌出较多的松果激素。松果激素可以调节人体内其他激素的含量，它增多时，可使得甲状激素、肾上腺素的浓度相对降低，而这些激素是唤起细胞工作的，若相对减少，人就显得无精打采、委靡不振；及至天气晴朗时，松果分泌减少，体内其他激素就会相对增多，所以人们就显得生气勃勃、情绪良好。另外，通常人晚上的血压比白天低，这也是由于晚上没有阳光，人的松果激素增加，抑制了其他激素分泌的缘故。