多年以来，各国学者纷纷撰文分析考证“无敌舰队”覆灭的原因，主要归纳出以下三种论点。第一种论点，是从西班牙和英国当时国力强弱的角度进行阐述的。持该观点的学者认为，16世纪的西班牙的势力虽然盛极一时，其殖民和海外贸易遍及亚、非、欧和美洲大陆，但这种繁荣仅仅是暂时的表面现象。第二种观点认为，西班牙“无敌舰队”的覆灭，是因为西班牙国王腓力二世用人不当造成的。腓力二世原本任命的是当时西班牙最有实力的海军宿将克鲁兹上将为舰队总司令，不料克鲁兹上将却突然死亡。腓力二世只好派米地拉·西尼多亚公爵接任舰队司令。第三种观点认为，天灾才是“无敌舰队”覆灭的主要原因。首先，舰队起航的时间选择不当。“无敌舰队”在5月起航，当时的大西洋风涛险恶，在进入柯鲁拉避风时，他们发现补给品腐烂了很多，淡水也漏掉了许多，船只普遍需要修补，很多人生病。以至于在后来，腓力二世也对天叹道：“我派“无敌舰队”是去和英国人作战，而不是去和海浪作战。”