新冠核酸检测是否痛苦要看其取样本的位置。因为核酸检测的方式有很多，比如取咽拭子、抽血、留痰、肺内灌洗等，所以得看取样本的方式方可知晓是否疼痛，一般都是应用咽拭子的方式，因为这种方法基本上是无创的，所以痛苦程度比较轻的，在检测过程中会让患者张嘴发出“啊”的声音，然后用无菌棉签在咽喉壁上擦拭几下，可能会有恶心的反应，但是很快就会缓解。
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