历史上虽没有记载吕不韦的后代，但吕不韦应该是有儿女的。根据历史记载分析，吕不韦的后代应该迁到巴蜀一地了，但秦始皇并不是他的儿子。
吕雉是汉高祖刘邦的皇后，传说有可能是秦始皇嬴政时期仲父吕不韦的族人，高祖死后，被尊为皇太后，是中国历史上有记载的第一位皇后和皇太后。她的手段很高，最终坐上这个宝座全是自己争取的。
吕布，东汉末年的枭雄，是战国时秦的宰相，曾经被疑为秦始皇嬴政的生父。但是目前尚无证据表明此二人有任何关联，只是同姓不足为据。
至于跟秦始皇的关系，早就已经得到了解释。当年秦庄襄王驾崩，13岁的嬴政被立为秦王， 当时吕不韦为秦相，独擅大权。在这期间，吕不韦可以说是万人之上，权倾朝野，无人能撼动的了他的地位，而且跟赵姬的关系一直不明不白。
据历史记载，赵姬嫁给庄襄王之后才怀孕，根据出生的日期来判断，秦始皇就是赵姬跟庄襄王的儿子。吕不韦当时身份特殊，一般是不会将自己的后代公布于世的。