不能。
病毒核酸检测阳性多可以确诊该病毒感染，以新型冠状病毒肺炎为例，阳性病例的判定是同一份标本中新型冠状病毒2个靶标（开放读码框1A/B、核壳蛋白）特异性实时荧光RT-PCR检测结果均为阳性，如果仅单靶标核酸检测阳性，病人虽不能确定为病毒感染，但也不能排除被感染，所以临床医生会根据检测结果并结合病程多次采样检测，另外核酸阴性结果也不能排除被新型冠状病毒感染，需要排除可能产生假阴性的因素。
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